GeoMx DSP のデータ分析ソフトウェアは、データの視覚化と解釈を容易にします。定量的なプロファイリングデータとともに高解像度の画像を表示し、どちらのデータセットもリアルタイムで操作することができます。
GeoMx DSP のしくみ
このアッセイは、RNA プローブと光切断可能なオリゴヌクレオチドタグを使用します。スライドに貼り付けたホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織切片にプローブをハイブリダイゼーションした後、UV 照射により組織内の選択された分離領域からオリゴヌクレオチドタグを遊離させます。遊離したタグは RNAseq または標準の nCounter アッセイを用いて定量化され、数値が組織の位置と照合されます。これにより、分析物の存在量に関する空間的に分解されたデジタルプロファイルが得られます。1